接下来要讲的故事，是三千万年前发生的，在超古代巨人们离开地球之后的故事。
这时候的地球因为齐杰拉的原因，超古代的人类选择了灭亡。
而奥特曼身为光，他们没办法干预人类的选择。
最终失望的离开了地球。
迪迦也在将自己战斗的身体留在金字塔内后也离开了。
但或许是人类命不该绝，一道来自宇宙中的光芒融入了这颗星球，和这颗星球结合之后诞生出了属于地球的光之巨人。
也就是盖亚和阿古茹。
没有人知道这股光芒是从哪里来的，又为什么选择了地球。就连盖亚和阿古茹也不明白，只记得孕育了那道光芒的星球似乎因为某种原因而消失了。
那是一颗和地球高度相似的星球，或许就是因为这个原因他们在来到了这里。
那颗星球明明确实存在过。
但是却因为某种不可抗力而彻底消失了，就好像从来都没有出现过。
不过这些事他们也毫不在意。
起初盖亚和阿古茹也不想干预人类的选择，毕竟他们和那些离开的巨人们一样是光，是不能干预人类的选择的。但是他们注意到了，还有一群孩子没有放弃希望。
一群有着最纯洁的灵魂的孩子。
他们希望自己的父母能够从齐杰拉的美梦中醒过来，但一群小孩子又怎么可能和齐杰拉抗衡呢？
不过就算是这样，那群孩子依旧没有放弃。
那些孩子们拿起了武器反抗，试图将齐杰拉从这片土地上铲除。
但这注定是要失败的。那时候的盖亚和阿古茹不明白，不明白为什么这群人类要这么做，直到他救了一个孩子。
那是盖亚第一次接触到情感。
这时候盖亚意识到了，或许自己的诞生就会为了拯救这群人类。
后来盖亚和阿古茹联手消灭了齐杰拉，让那些深陷环境中的人类成功找回了自我。那些醒来的人们看着这两位从未见过的光之巨人，起初他们还在埋怨盖亚和阿古茹。
埋怨他们为什么不让自己在快乐中死去。
但也就是在这时候恐怖的事情发生了，还没等【黑暗的支配者】降临，另一道更恐怖的黑暗就笼罩了地球。
也是在黑暗降临之后，无数的异生兽一同出现。
以超古代人类的恐惧为食，不断的成长，不断的增殖，而盖亚和阿古茹又没有消灭异生兽的办法。
就算侥幸杀死了一只，也会在不久之后卷土而来。
并且同样的办法不会再次奏效。
就这样，地球再次陷入毁灭的危机。造成这一切的罪魁祸首就是那片黑暗的源头，一个极其恐怖的恶魔——黑暗路西法。
一对山羊般向后延伸的头角，头角内有着放射状的纹路，额头上巨大的水晶就像是它的第三只眼睛。
全身以黑色为主，身上布满了不规则的银色花纹。
后背有着类似于诺亚之翼的翅膀，而且还是上下两对！其中蕴含的力量根本就无法想象！
面对这种敌人。
就算盖亚和阿古茹再强，在黑暗路西法的面前也只是蝼蚁罢了。
哪怕是后面诺亚降临到地球上，也不过是延缓了人类毁灭的时间而已，依旧看不到任何的胜算。最后，盖亚和阿古茹将自己所有的能量都交给了诺亚，自己则是因为耗尽了能量而陷入了长久的沉睡。在那之后发生的事情就不得而知了。
……