明朝制度是“将不专兵，兵不私将”。明朝的兵和将不是在一起，而是分开独立的，需要打战的时候才集结一起。这样能够防止大将拥兵自重造反，但是作战起来，则是效率低下，管理混乱和训练不足。
兵源问题就是“垛集军”。“垛集军”就是把大批人民划为军籍，世代相传。一般把自己的对头变成垛集军的来源。也就是军户。
军户的生活相当悲惨，他们被强制的军事屯田，世代不得脱籍，军饷微薄，战时做炮灰，平时做苦力，逃亡则采取连坐，强制亲戚家人代替。这样的兵源先天缺乏强大战斗力和高昂的士气。而且这种“为战而战”的“职业”士兵很容易军心涣散，厌战心理很强。从神宗开始，又采用了募兵制的征集部队方式。一般结果是民众将军饷一抢而空，然后四处逃命。
养兵问题。明朝实行军事屯田制度，的确是自力更生，不花国家的钱。但是在战争时期是行不通的，如果皇帝以可以屯田为借口克扣军饷，很容易导致兵变，军人生活已经困苦不堪，还要克扣正常开销，只会使得军队缺乏训练，战斗力低下，并且毫无斗志。战争时期军饷是极其严重的问题。
军官问题，想要上升一步，只能以钱来谋升官，升官后自然要千百倍的剥削回来。军队的管理这也是这样，军官大肆贪污，虚报兵数。于是军费开销越来越大，户部这儿越来越没钱，只有加重老百姓的赋税。就这样矛盾越来越激烈，军事问题却没有解决。政治上的战略直接影响着战争的战略。这是军队军官**的最大根源，也是所有末世最主要的原因，国家是强大的统治工具都毁了与了**之中，一旦遇到了风吹草动，这就是相当危险的。
以上的种种军事制度，就是大明战斗力低下的最大根本原因，皇上当然受不了这种局面，所以自己去组建、训练亲兵。实践说明，皇上的这一步走的相当的英明，直接扭转了大明与异族之间仅仅是以防为主为全部的军事政策，从而能走出城池，可以打野战、打大仗、打胜仗。这让全国均为之一震。
至于皇上如何安排那些没有入选亲军预备役，或者以后也不可能有入选机会的兵将，这样的问题还真不是他一个做臣子的应该说的。大同精忠队剩下的兵，皇上的确是给安排了，要他们去岱海还是归化城，但很可惜，那些兵根本不听。
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