抗日战争开始后，南方8省红色游击队统一整编为国民〖革〗命军陆军新编第四军，赖传珠被任命为参谋处处长。新四军江北指挥部成立后任参谋长，成为张云逸总指挥的得力助手，完成了编制和各种制度的制定，起草了建军中的政治工作、民运工作提纲和恢复政治委员制度等文件。面对国民党顽固派不断制造摩擦，始终保持着高度警惕，主持召开反顽会议，制定反顽措施，调配兵力，并指挥部队进行反击作战。
一九四零年底，黄克诚率八路军第二纵队南下与新四军会合后，成立了统一指挥华中八路军和新四军的华中总指挥部，赖传珠任参谋长。
皖南事变后，任新四军参谋长，参与了新四军的整编工作。在一九四一年初的苏中、苏北根据地反“扫荡”期间，指挥新四军第一师主力，打垮了公开投降日寇的国民党李长江部，并部署苏中新四军和淮南地区军民作战数十次，胜利地粉碎了日军对抗日根据地的“扫荡”一九四一年五月中共华中局成立，并同时组成〖中〗央〖革〗命军事委员会华中分会，赖传珠任华中局常委和分会委员。参与了华中局高级干部会议和华中军分会扩大会议的组织领导工作，对会议的成功作出了贡献。特别是在军事建设方面，对加强军事训练和司令部工作建设，健全司令部机关和提高干部的组织指挥能力，提高部队的战术、技术水平，建立严格的政治、军事纪律以及培养坚决服从命令的作风，都倾注了全部心血和精力。之后，又协助陈毅代军长指挥新四军部队，粉碎了日军的多次“扫荡”、蒋介石发动的第三次反共高潮，以及战略反攻阶段的攻势作战。
抗日战争胜利后，任新四军第一纵队政治委员。后调东北战场任东满军区副司令员。
一九四七年九月任东北〖民〗主联军第六纵队政治委员。在此期间，先后率部参加了三下江南、四保临江、攻打锦州等战役和围歼廖耀湘兵团的辽西会战，为东北全境的解放作出了重要贡献。一九四八年十一月，赖传珠任东北野战军第四十三军政治委员，率部队迅速入关，与兄弟部队一起完成了对北平之敌的包围。一九四九年一月升任第四野战军第十五兵团政治委员，率部进军中南，并参与了解放海南岛战役和解放万山群岛作战的指挥。
一九五零年八月，赖传珠调任第四野战军第十三兵团政治委员。
一九五零年九月，调任军委总干部管理部第一副部长，协助罗荣桓部长统一管理全军的干部工作，逐步建立起一套正规的干部管理制度。后又协助罗荣桓，为积极贯彻中共〖中〗央的建军方针和建校培养干部人才的决定，作出了巨大的努力。一九五三年底〖中〗央军委召开扩大会议，就人民解放军的编制、训练、党委制度，以及实行义务兵制、薪金制、军衔制等重大问题作出新的规定。会后，为贯彻落实会议的精神和具体实行各项新的制度，做了大量的组织领导工作，对推动人民解放军的现代化、正规化建设进程作出了贡献。一九五五年被授予上将军衔，荣获一级八一勋章、一级独立〖自〗由勋章、一级解放勋章。一九五八年十月，赖传珠调任北京军区政治委员。一九五九年十月，调任沈阳军区政治委员，所树立的雷锋和模范红九连等先进典型，对全军全党全国人民的思想建设起到了重要推动作用。他是第二、三届国防委员会委员，第一、二、三届全国人民代表大会代表。赖传珠于一九六五年十二月二十四日因病在沈阳逝世，终年五十五岁。
“杨国夫，看不出来啊，你可以啊，怎么了，现在你学会和组织讨价还价了，怎么，现在组织上给你安排什么工作，你都不去执行了啊。怎么，要不我现在把这个纵队的司令让给你杨国夫来做，我带着你们师去执行任务。”面对着杨国夫坚决要请战的想法，不管是张心，还是林彪，甚至是罗荣桓现在是都没有时间来处理这个事情，所以，没办法，罗荣桓只能是直接的联系了现在的六纵的司令员洪学智和赖传珠两个人，让他们两个人去接解决这个事情，所以，杨国夫就直接的来找洪学智和赖传珠了，等杨国夫刚刚的把自己的想法给洪学智和赖传珠说了之后，洪学智是一点面子也没有给杨国夫留啊，直接的对着杨国夫大声的说到。不得不说，洪学智对杨国夫说的这番话啊，在那个年代，还是相当严重的一番话了。
“不是，洪司令，我不是这个意思，我的意思是，这次围攻长春的战役，攻占长春可以说是，我们整个战役的最重要的地方，而我们六纵呢，则是执行这个任务的主攻，可以说，我们六纵是重中之重了，但是，这么重要的任务，为什么就偏偏的让我们师留守呢，这一点我想不通，是我们师不能打仗，还是我犯了什么错误了，让野司和纵队的首长，这么的看我不上眼。”杨国夫听了洪学智的话之后，要说不害怕，那是假的，但是，这个时候，杨国夫知道，如果自己要是害怕了就不继续争取的话，那么，这个机会可就是真的丧失了啊。
“杨国夫，你胆子太大了吧，怎么，野司和纵队在战役的安排上面具体怎么安排，是不是还得亲自的像你杨国夫汇报一下啊，我告诉你杨国夫，这个命令，你就是执行也得执行，不执行，那也得执行，没有什么商量的地方，好了，我还有事情，你该去哪去哪吧，没工夫搭理你。”洪学智这个时候拿出了纵队司令的派头，直接的对着杨国夫下了逐客令了。
“司令员，我”这个时候，杨国夫还想在为自己争取一下，但是，这个话还没有说出来呢，就直接的被赖传珠给挥手打断了，所以，杨国夫这个时候就只能选择闭嘴了。
“杨国夫同志，你要知道，这次之所以让你们师去担任哈尔滨的警戒任务不是野司和纵队说对你们师或者说你个人有什么不满的情绪，而且，恰恰相反的是，野司和纵队把这个任务交给你们是对你们师德信任知道么，这次我们野战军可以说是倾巢出动，那么，哈尔滨的防御，就要显得空虚了，如果这个时候国民党的部队抓住了我们哈尔滨防御比较薄弱的这一点，派人去对我们野司的首长进行对他们人身安全不利的活动怎么办，所以这次，你杨国夫不要以为不上战场，任务就不重要我告诉你，你的任务是最重要的，你就是要不惜一切代价的去保证野司的司令部和我们野司的首长安全，怎么，这个任务，你杨国夫有什么不乐意的，、，赖传珠这个时候没有向洪学智那么义正言辞，但是这个时候，赖传珠说出来的话的分量，却相当的不低，直接的就把话给说到了杨国夫的心坎里面去了啊。
“原来是这个样子啊，好的洪司令，赖政委，你们放心吧，我杨国夫知道自己的错误了，我想首长们保证，我一定完成任务保卫野司司令部和野司首长的安全啊，请洪司令和赖政委放心。”杨国夫听了赖传珠的话之后，马上的就明白赖传珠的意思了那个时候，当兵的人都是直肠子脾气来的快，取得也快，尤其那个时候，下级一听说自己事情参加保卫首长的行动的时候，那没说的，坚决完成任务啊，所以，杨国夫非常爽快的说到。
就这样，解放军的所有部队，至此，在围攻长春的战役中，全部的就位，可是，就是这样的等了两天的时间，不管是解放军这边，还是国民党军队那边，两边人都是相当的郁闷啊，不是说打仗么，这个仗在哪里呢，怎么就没有见仗打起来呢。
“张司令员，这个情况不行啊，我们现在的部队，虽然说已经全部的进入到阵地了，但是，好像国民党那边的部队，并没有上当啊，还是全部的都在自己的阵地里面，没有任何的要求增援长春的意思。只要新六军一支部队出来了，那样我们就要被动了啊。”刘亚楼这个时候，拿着战情通报，向张心和林彪两个人进行汇报，并且请张心指示。