1中央官制
东汉的中央政府组成沿用西汉官制，以三公领九卿为基本架构。但是实际政治权力已经完全转移到尚书台。东汉皇帝即位，往往以太傅或太尉录尚书事，总领政务。御史台体制贬损，成为少府属官。侍中从西汉的加官转为正式职务，设侍中寺作为侍中的正式官署，隶属少府。
太傅
东汉一朝，由于讲求经术，太**臣中以太傅为首。太傅借此向太子灌输自己的政治理念。太子即位后，往往以太傅录尚书事，成为事实上的丞相。历史上，赵熹、邓彪、张禹、冯石、冯鲂、桓焉、赵浚均以太傅录尚书事。太傅死，即除此官（不再任命），以示崇重。汉灵帝时，以陈蕃为太傅录尚书事，后来陈蕃被处死，以胡广继任，这是唯一的例外。
与西汉以太师、太傅、太保为上公不同，东汉唯以太傅为上公，无太师、太保官。汉献帝时，董卓迁都长安，自任太师，位在太傅上。这是权臣擅权所为，死后即废。
据《汉官》记载，太傅所属官吏有：长史一人，秩千石，掾属二十四人，令史、御属各二十二人。长史为太傅府群吏之长，掌章奏、顾问。掾属是比较高级的属吏，分曹办事。令史、御属是比较低级的吏员，办理文书、车马等琐事。
三公
东汉以太尉、司徒、司空为三公，位次上公。三公师长百僚，名义上为最高官职，其实并无实际权力。
东汉任命三公多以知名经师为之，以宣扬经术治国的理念。其实不过是政治花瓶而已。皇帝以尚书参决政务，并不以实权付三公。因三公以硕儒经师居官，所以往往要为很小的差错承担非常严重的责任，以示高节。例如：宋弘为大司空，在位五年，因考核上党太守无所依据而免官。伏湛行大司徒事，以冬祭高庙（汉高祖刘邦的宗庙），因河南尹与司隶校尉在庙中争论失仪，而伏湛没有上奏此事，免官。汉光武帝对大臣非常严厉、苛刻，韩歆为司徒，以直言忤旨，免官遣归乡里，与其子皆自杀。之后，欧阳歙、戴涉相继任大司徒，下场都是论罪下狱、被处死。
太尉
汉光武帝即位，置大司马官，负责全国军官的考核，每岁末，评定等次，上奏皇帝，作为军官升迁、降调的依据，当时有大司马吴汉。
参考：《后汉书·百官一》太尉条原注：“掌四方兵事功课，岁尽即奏其殿最而行赏罚。”
建武二十七年（51年）改大司马为太尉。
按东汉制度，三公掌谋议国之大政。太尉的主要参政途径就是与司徒、司空共同讨论皇帝交议的国政，定议后会衔上奏。东汉一朝，仅见牟融、徐防以太尉录尚书事，与太傅参决政事。这说明太尉除非被任命为录尚书事，并没有决定政务的职权。
按东汉以三公领九卿的制度，太尉领太常、卫尉、光禄勋三卿。太尉府属吏有：长史一人，秩千石，总管各曹事务。各曹掾、史、属共二十四人。在诸曹中，西曹负责太尉府官吏的任免；东曹负责二千石的迁调；户曹负责户籍、祭祀、农桑；奏曹负责奏议；辞曹负责审理案件，接受上诉；法曹负责驿站事务；尉曹负责士卒和囚犯的征调、运输事务；贼曹负责缉拿盗贼；决曹负责裁决刑法；兵曹负责军事事务；金曹负责货币与盐铁事务；仓曹负责国家仓库事务。此外，还有黄阁，主簿，是阁下诸吏的长官。另有令史及御属二十三人，阁下令史负责太尉的仪仗执事；记室令史负责太尉府的奏章等各种文书的管理；门令史负责太尉府门卫。其他令史分隶诸曹，办理文书事务。从东汉太尉府诸曹的设置以及职掌来看，太尉的管辖范围似乎非常广，但那都是名义上的东西，太尉诸曹所领事务，或受制于尚书台，或仅仅为文牍往来，本身并没有可否之权，而且太尉对本府诸曹事务并没有实际节制的权力。
司徒
汉光武帝即位，置大司徒官，负责人民教化，掌礼仪诸事。与太尉、司空共同讨论皇帝交议的国政，定议后会衔上奏。
参考：《汉官仪》：“王莽时，议以汉无司徒官，故定三公之号曰大司马、大司徒、大司空。世祖（刘秀庙号）即位，因而不改。”《后汉书·百官一》载：“司徒，公一人。本注曰：掌人民事。凡孝民孝悌、逊顺、谦俭、养生送死之事，则议其制，建其度。凡四方民事功课，岁尽则奏其殿最而行赏罚。”
建武二十七年（公元51年），去“大”，称司徒。
司徒领太仆、鸿胪、廷尉三卿。属吏有长史一人，秩千石。掾属三十一人。
司空
汉光武帝即位，置大司空官，负责水利工程、城防建筑、宫室营建等事务。与太尉、司徒共同讨论皇帝交议的国政，定议后会衔上奏。
参考：《后汉书·百官一》云：“掌水土事。凡营城起邑，浚沟洫、修坟防之事，则议其利，建其功。凡四方水土功课，岁尽则奏其殿最而行赏罚。”
建武二十七年（公元51年）去“大”，称“司空”。汉献帝建安十三年（公元208年），改司空为御史大夫，职掌不变，不领御史台，与前代御史大夫仅仅是名称相同而已。
司空领宗正、少府、司农三卿。司空属吏有长史一人、掾属二十九人、令史及御属四十二人。
大司马
汉武帝废太尉设大司马，加于大将军、骠骑将军、车骑将军、卫将军之上。东汉光武帝又废大司马为太尉，为掌管军政和军赋的最高官职，即全国最高军事长官。东汉时太尉与司徒、司空并称三公。东汉光武帝刘秀时削弱三公的权利，后来三公几乎无实权只是荣誉的象征。东汉末年，三公（太尉、司徒、司空）已成为虚职，在三公之外另设大司马，大司马和大将军均位在三公之上，如刘虞、权臣李傕。三国时期，各国在三公之外另设大司马，一般由大将军升迁而来。如：魏国的大司马曹仁、曹休、曹真；蜀汉的的大司马蒋琬；吴国设有大司马和左大司马、右大司马，一般由大将军或者上大将军升迁而来，如丁奉、吕岱、陆抗、施绩、朱然。
九卿
东汉沿西汉制度，以太常、光禄勋、卫尉、太仆、廷尉、大鸿胪、宗正、大司农、少府为九卿。与西汉不同的是，东汉九卿分隶属三公。太常、光禄勋、卫尉三卿属太尉；太仆、廷尉、大鸿胪三卿属司徒；宗正、大司农、少府三卿属司空。
东汉九卿均于官称上加“卿”字，如太常卿等，秩中二千石。除此之外，东汉九卿与西汉不同者还有：一、光禄勋除西汉的五官中郎将、左中郎将、右中郎将、虎贲中郎将、羽林中郎将之外，增置东中郎将、北中郎将、西中郎将、南中郎将。二、少府尚书改称尚书台，由西汉的常侍曹、二千石曹、民曹、主客曹改为六曹：改常侍曹为吏曹，增三公曹，将主客曹分为南主客曹与北主客曹。尚书台增设左右丞二人，诸曹侍郎各六人，令史诸曹各三人，事务繁剧的曹增令史各三人。尚书台组织较西汉尚书要重要、庞大的多。
将军
在秦代以前，武职将军名号只有大将军、前、后、左、右将军。汉代将军不常设，主征伐。事毕则罢。汉文帝时始有车骑将军、卫将军。东汉的将军也是中央政府的重要组成部分，有大将军、骠骑将军、车骑将军、卫将军、前将军、后将军、左将军、右将军。大将军位在三公上，骠骑将军、车骑将军、卫将军位次列于九卿，位在三公下。前、后、左、右将军，位次列于九卿，不常置。东汉中期以后，太后临朝称制，外戚以大将军执政，与太傅、三公合称为五府。
以上将军均开府，府属有长史、司马各一人，从事中郎二人，掾属二十九人，令史御属三十一人。将军以本号领军的，各有部曲、校尉。
汉魏时期，有军功者比比皆是，授予官职的难度加大。因此常在“将军”前冠以某个名号以作为他的官职，这种名号并无一定，名号之间也无上下级关系，因此称为杂号将军。临事设置，事毕即撤。如骁骑、楼船、材官、伏波、贰师、度辽、龙骧等，或以所领部队（如骁骑、材官），或因奉行的任务（如李广利攻贰师城）。唯度辽将军因南匈奴所部时有内乱，自永平八年（65年）后常设。汉末以后，开始出现四征、四镇、四平、四安等重号将军。
2地方官制
东汉的地方官制与西汉相比较，在郡、县两级是基本相同的，不过郡的重要性和权力较西汉下降很多。在州一级，则有根本性的差异，东汉的州已经演变成为一级地方，凌驾于郡之上。至此，中国古代的地方行政区划由郡县制转变为州、郡、县三级制，一直延续到隋朝“废郡”为止。
州刺史
东汉将洛阳之外的地区划分为十二个州，各遣刺史一人为长官。另以京兆、左冯翊、右扶风、河东、河南、河内、弘农七郡为司隶校尉辖区，称司隶部（汉代州也称部）。
司隶校尉是京官，本职为监察在京百官诸不法事。东汉时，每每退罢三公均由司隶校尉纠劾所致，所以司隶校尉号为“雄职”。皇帝召集朝会的时候，司隶校尉与御史中丞、尚书令三人有单独的席位，称“三独坐”。司隶校尉秩比二千石，属官有从事（流行的韩剧中每每出现的从事官就是由此得名）、假佐（假：代理的意思；佐：助手的意思。就是说是可以代行事务的助手）等，另统领一支由一千二百名奴隶组成的武装警察部队，司隶校尉的官名也由此而得。
诸州沿西汉汉成帝制度，设州牧一人，秩二千石。建武十八年（公元42年）改刺史，秩六百石。汉灵帝中平五年（公元188年），再改州牧，秩二千石。东汉刺史有固定的驻地和官署，纠劾所部太守县令不必如西汉制度上三公按验，可以直接罢免之。改州牧后，兼领军政，位高权重，有点类似于唐朝的节度使，而管辖地域的广阔，又不是节度使所可以相比的。
与西汉相同的是，刺史也要周行郡国，查探政情，年终回京复奏。不过东汉的刺史不必亲自回京，而是派遣属吏向司徒府报送文书而已。
郡国
东汉共设郡国一百零五：王国二十七，司隶部属郡七，列郡七十一。除司隶部所辖七郡外，王国与列郡均分隶诸州，其中豫州领郡国六，冀州领九，兖州领八，徐州领五，并州领九，幽州领十一，青州领六，荆州领七，扬州领六，益州、凉州各领十二，交州领九郡。
东汉制度，皇子封王，以郡为国。每国置傅、相各一人。傅主王府事，职如汉朝的太傅；相如郡太守，主政务；相有长史一人，职如郡丞。另置中尉一人，秩二千石，职如郡都尉，是主管军政、缉捕盗贼的军官。
王府置郎中令一人，秩千石，职务和汉朝的郎中令相类似，主管王府的大夫、郎等；仆一人，秩千石，负责王府的车马训练与驾驭；治书数人，秩六百石，职如尚书；谒者数人，秩四百石，职务是奉王命出使；另有礼乐长、卫士长、医工长、永苍长、祠祀长等，秩皆比四百石。
郡太守秩皆二千石，只有河南郡因京师所在，长官称河南尹，位比九卿，秩中二千石。诸郡各置丞一人，位次太守，秩六百石，负责民政事务；边郡（就是设置在边境地区的郡）另置长史一人，秩六百石，负责军政事务。长史之下有司马一人，负责具体军事指挥。东汉内地不设郡都尉，以太守领兵。边郡置都尉或属国都尉领军并辖县，地位略与内地较小的郡相仿。如汉和帝永元元年（公元89年），置西河属国都尉、上郡属国都尉；永和十五年（公元105年）置辽东西部都尉；汉安帝置右扶风都尉、京兆虎牙都尉等。
县
东汉的县级地方建制与西汉相同。
列侯以县为封地则称侯国，侯国置相一人，相当于县令或县长（以侯国大小为异），相不隶属于列侯，但负责为列侯征收租税。封国户数在千户以上的，置家丞、庶子各一人，是侯府官，不管理民政；不满千户的，只置庶子一人。东汉的侯另有乡侯、亭侯，所封之地各为一乡、一亭，这样的封地辖于所在县，与乡、亭相等。
皇后、皇太后、公主的封地称邑，置令、长。邑的体制与侯国相当。
少数民族聚居地设道，隶属于郡，多设于巴、蜀等西南地区，以少数民族部落首领为道的长官。
万户以上的县置县令一人，秩千石；县丞一人，掌民政、文书、仓库；县尉二人，掌治安。
万户以下的县置县长一人，秩三百石或四百石；县丞、县尉各一人。
东汉诸县出产盐的，置盐官，负责管理盐场、盐矿，征收盐税。出产铁的县置铁官，负责冶炼、铸造。在手工业发达的县置工官，负责管理工匠、征收工商税赋。在水产发达的县置水官，负责管理渔场、征收税赋。以上这些官吏不隶属于郡县，均隶属于少府，属于派出机关。
东汉在县以下的官制与西汉无异，具体可以参见西汉官制。
3官职列表
秩万石
即：月奉三百五十斛
上公：太傅、大司马（东汉末年于三公之外别置大司马，位在三公之上）
三公：太尉、司徒、司空
将军：大将军（大将军有时位在三公上，有时位在三公下）、骠骑将军
秩中二千石
即：月奉百八十斛
太尉领：太常卿、光禄勋、卫尉
司徒领：廷尉、太仆、大鸿胪
司空领：少府、宗正、大司农、
将军：车骑将军、卫将军、前将军、后将军、左将军、右将军
太子太傅、执金吾、河南尹、京兆尹、左冯翊、右扶风
秩真二千石
即：月奉百五十斛
后汉书未记载有“秩真二千石”及其官职，或言真二千石即为二千石。存疑
秩二千石
即：月奉百二十斛
地方长吏：郡守、州牧
诸王国属官：国相、国傅、（王国）御史大夫及诸卿
大长秋、太子少傅、将作大匠、度辽将军等诸杂号将军（骁骑、楼船、伏波、龙骧等）秩比二千石（月奉百斛）
少府属官：侍中、中常侍
光禄勋属官：五官中郎将、左中郎将、右中郎将、虎贲中郎将、羽林中郎将、奉车都尉、驸马都尉、
骑都尉、光禄大夫
北军中侯监领：屯骑校尉、步兵校尉、越骑校尉、长水校尉、射声校尉
将军部曲：大将军营五部校尉
诸王国属官：中尉
司隶校尉、属国都尉、使匈奴中郎将、护乌桓校尉、护羌校尉、城门校尉、都护将军
秩千石
即：月奉九十斛
将军府属官：将军长史、将军司马
太傅府属官：太傅长史
三公属官：三公长史
少府属官：御史中丞、尚书令
廷尉属官：廷尉正、廷尉左监
光禄勋属官：太中大夫
大长秋属官：中宫仆
太子少傅属官：太子率更令、太子家令、太子仆
城门校尉属官：城门司马、平城门屯司马
北军属官：屯骑校尉司马、步兵校尉司马、越骑校尉司马、长水校尉司马、胡骑司马、射声校尉司马
诸王国属官：郎中令、仆
诸侯国属官：诸侯国相
地方长吏：县令、汤沐邑令、道令
秩比千石
即：月奉八十斛
太常属官：太常御
太仆属官：太仆丞
廷尉属官：廷尉丞
卫尉属官：卫尉丞、宫门司马、掖门司马
宗正属官：宗正丞
少府属官：少府丞
大司农属官：大司农丞
大鸿胪属官：大鸿胪丞、
光禄勋属官：光禄丞、谒者仆射、
执金吾属官：执金吾丞
将军部曲：军司马
秩六百石
即：月奉七十斛
将军府属官：从事中郎
太常属官：太史令、太祝令、博士祭酒、太宰令、掌故、大予乐令、高庙令、世祖庙令
光禄勋属官：光禄左仆射、光禄右仆射、左陛长、右陛长、羽林左监、羽林右监、中散大夫、谏议大夫、议郎
卫尉属官：公车司马令、南宫卫士令、北宫卫士令、左都候、右都候
太仆属官：考工令、车府令、未央厩令
廷尉属官：廷尉左平
大鸿胪属官：大行令
宗正属官：公主家令、主簿、仆、私府长
大司农属官：大司农部丞、太仓令、平准令、导官令
少府属官：
·守宫令、上林苑令、太医令、太官令、黄门侍郎、小黄门、黄门令、掖庭令、永巷令、御府令、
祠祀令、钩盾令、尚方令、中藏府令、内者令、符节令、兰台令史；
·尚书令属吏：尚书仆射、六曹尚书（吏曹尚书、二千石曹尚书、三公曹尚书、民曹尚书、
南主客曹尚书、北主客曹尚书）；
·御史中丞属吏：治书侍御史、侍御史
执金吾属官：武库令、左中候、右中候、
大长秋属官：大长秋丞、中宫谒者令、中宫尚书、中宫私府令、中宫永巷令、中宫署令
太子少傅属官：太子中庶子、太子门大夫、太子仓令、太子食官令
将作大匠属官：将作丞、左校令、右校令
城门校尉属官：城门门候
司隶校尉属官：都官从事、功曹从事、别驾从事、簿曹从事、兵曹从事、主簿、门亭长、
门功曹书佐、律令师、孝经师、月令师、律令师、簿曹书佐
掌监北军：北军中侯
度辽将军属官：度辽将军长史度辽将军司马
地方长吏：州刺史、郡丞、边郡长史、右扶风京兆每次县令
护乌桓校尉属官：拥节长史、司马
护羌校尉属官：拥节长史、司马
秩比六百石
即：月奉五十斛
太常属官（博士祭酒属吏）：博士
光禄勋属官：
·五官中郎将属吏：五官中郎；
·左、右中郎将属吏：左中郎、右中郎；
·虎贲中郎将属吏：虎贲左仆射、虎贲右仆射、虎贲左陛长、虎贲右陛长、虎贲中郎；
·谒者仆射属吏：常侍谒者；
将军部曲：曲军候
太子少傅属官：太子洗马
诸王国属官（中尉属吏）：治书、大夫
秩四百石
即：月奉四十五斛
太常属官：太常掾
少府属官：
·黄门署长、画室署长、玉堂署长、直里监
·尚书令属吏：尚书左丞、尚书右丞、尚书侍郎
光禄勋属官：给事谒者
大长秋属官：中宫谒者、中宫药长
太子少傅属官：太子庶子、太子厩长、太子卫率、太子中盾
地方长吏：县长、汤沐邑长、道长
县令属官：县丞、县尉
秩比四百石
即：月奉四十斛
三公、将军府掾：东曹掾、西曹掾、主簿
光禄勋属官：五官侍郎、左侍郎、右侍郎、虎贲侍郎
诸王国属官：谒者、礼乐长、卫士长、医工长、永巷长、祠祀长
秩三百石
即：月奉四十斛
太常属官：太史令丞、太祝令丞、太宰令丞、大予乐令丞
光禄勋属官：羽林左监丞、羽林右监丞
太仆属官：考工丞、车府丞、长乐厩丞
大鸿胪属官：大行令丞、大行治礼郎、廪牺令丞、楫棹丞
宗正属官：公主家丞
大司农属官：太仓令丞、平准令丞、导官令丞
少府属官：
·守宫令属吏：守宫令丞
·永巷令属吏：永巷丞
·祠祀令属吏：祠祀丞
·太医令属吏：太医药丞、太医方丞
·黄门令属吏：黄门丞、黄门从丞
·内者令属吏：内者左丞、内者右丞
·御府令属吏：御府丞、御府织室丞
·钩盾令属吏：钩盾丞、钩盾永安丞
·掖庭令属吏：掖庭左丞、掖庭右丞、掖庭暴室丞
·太官令属吏：太官左丞、太官甘丞、太官汤官丞、太官果丞
·中藏府令属吏：中藏府丞
·上林苑令属吏：上林苑丞、上林苑尉
执金吾属官：武库丞
大长秋属官：中宫私府丞、中宫永巷丞、中宫署丞、中宫复道丞
将作大匠属官：左校丞、右校丞、
州刺史属官：治中从事、别驾从事、簿曹从事、兵曹从事、主簿、门功曹书佐、簿曹书佐
诸王国属官（国相属吏）：长史
地方长吏：（小）县长
秩比三百石
即：月奉三十七斛
三公、将军府掾：户曹掾、奏曹掾、辞曹掾、法曹掾、尉曹掾、贼曹掾、决曹掾、兵曹掾、金曹掾、
仓曹掾
郡守诸曹掾史：功曹史、户曹史、奏曹史、辞曹史、法曹史、尉曹史、贼曹史、决曹史、兵曹史、
金曹史、仓曹史、五官掾、五部督邮、曹掾、主记室史
少府属官：中黄门
光禄勋属官：五官郎中、左郎中、右郎中、虎贲郎中、羽林郎、灌谒者郎中
卫尉属官：公车司马丞、公车司马尉、南宫卫士丞、北宫卫士丞、左都候丞、右都候丞
秩二百石
即：月奉三十斛
少府属官：
·符节令史、